circRNA研究之：circRNA常用数据库介绍|分享
上期整理了常用的LncRNA数据库及预测网站，点击这里查看LncRNA研究之：LncRNA数据库及预测软件汇总。
近两年circRNA研究越来越热，2017年circRNA国自然立项数突破100，达到118项，相比2016年增长了123%。近期circRNA的相关研究也是成果不断，例如今年8月31日顶级医学期刊CIRCULATION在线发表了复旦大学附属眼耳鼻喉科医院颜标教授和赵晨教授作为共同通讯作者的题为：Circular Non-Coding RNA HIPK3 Mediates Retinal Vascular Dysfunction in Diabetes Mellitus的文章，文章分析了circHIPK3在糖尿病视网膜血管功能性障碍中的作用，发现了circHIPK3通过竞争性结合miR-30a-3p进而影响下游基因VEGFC/WNT2/FZD4,丰富了对糖尿病视网膜血管功能障碍疾病机制的认识，更提出了有价值的疾病诊断和治疗备选方案。
circRNA研究可谓如火如荼，BioWorld特整理了最常用的几个circRNA数据库，供大家参考
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circBase数据库
circBase:该网站收录了人、小鼠、线虫、果蝇等物种的circRNAs信息。通过搜索框检索即可查询包括染色体信息、所在基因组位置、转录本长度、来源样本等circRNA的基因信息。目前最常用也是最方便的circRNA查询网站。网址：http://circrna.org/
CircNet数据库
CircNet:数据库数据来源基于转录测序结果，并进一步联合microRNA等信息进行了整合分析，功能强大。该数据库整合了以下信息：circRNA分子序列；circRNA与miRNA及靶基因的调控网络；circRNA分子的表达谱；circRNA分子的基因组注释。网址：http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/
CircInteractome数据库
CircInteractome:该数据库可以做circRNA的PCR引物设计，同时还提供了针对circRNA的siRNA序列设计。网址：http://circinteractome.nia.nih.gov/
deepbase数据库
deepbase:中山大学推出的数据库，主要强调ceRNA分子网络互作，其中也整合了circRNA相关信息。整合了circRNA相关数据库知识。网址：http://deepbase.sysu.edu.cn/
近期预告
1.环状RNA（circRNA）研究方法及代表性文章解读
2.CRISPR/Cas9中gRNA在线设计工具及使用教程
3.近两年生物/医学领域国人发文最多的6-10分SCI期刊盘点